Bookendsアプリの不具合が解消
Apple IDのトラブルと合わせて、文献管理に使っているBookendsアプリの挙動がおかしくなっていたのですが、こちらはApple IDのせいではなく、アプリ側の不具合だった模様で、問い合わせメール送信から2日程度で解消しました。以下、メモ書き的に。
症状：iCloudにPDFファイルが存在しているにも関わらず、iOSアプリからだと関連付けられたPDFが開かない。MacOSからは問題なく開く。
ファイルの同期に関する症状だったので、Apple IDトラブル（こちらはまだ継続中・・・）に起因してるのかとヒヤヒヤしたのですが、こちらについてはiPhoneや旧iPad（Apple IDのトラブルが起きてない方）でも発生してしまったため、もしかしてアプリ側の問題か？とも考え、サポートにメール送信。
2往復くらいのやり取りで「アプリに不具合があった」とのことで、その日のうちに最新版アプリが公開され、無事に事なきを得ました。
PDFの注釈書き込みやメモ作成など、比較的使いやすいということもあり、現在レビュー中の論文などもごっそりと入れ込んでいるため、動いてくれて一安心でした。